信息工程学院通信工程系成立于2012年，前身为通信工程教研室，2004年开始计算机通信专科专业招生，在获批本科专业后，于2009年开始通信工程本科招生。2017年10月，经学院优化调整，将网络工程专业纳入通信工程系。网络工程专业于2016年开始本科招生。

通信工程系现有专职教师15人，其中副教授7人，讲师8人，在读博士2人，硕士比例100%，是一支以青年教师为主体，结构合理、充满活力、求实创新、具有较高专业水平的教学队伍。近年来，依托新疆南疆农业信息化研究中心等科研平台，形成教学、科研密切联系、相互促进的学科发展与创新模式。共承担国家自然基金项目5项，校级项目14项，校外联合项目1项，发表学术论文20余篇，其中SCI级别3篇。

通信工程系坚持深化教学改革，注重教学质量的提高。近年来获得校级教学成果奖三等奖1项，青年教师讲课竞赛、教学质量优秀奖、实验教学竞赛等10余项奖项；指导学生参加大学生创新创业训练项目、中国“互联网+”大学生创新创业大赛、“篮桥杯”软件设计大赛等各类学科竞赛，获得各类奖项40余项。2017年，通信工程专业获批校级专业综合改革试点项目；通信与网络工程实验中心获批校级实验教学示范中心项目；《通信原理》获批校级重点课程。

近年来，通信工程系为本地区输送了三百余名优秀的通信专业人才，广泛受到社会的欢迎与青睐，其就业率达97%以上。