计算机科学与技术专业现开设有3个专业方向：计算机工程、软件工程和计算机网络工程。随着信息化的发展，疆内外对信息化人才需求迫切。经过多年发展，目前，计算机科学与技术专业的教学质量逐年提高，学生就业率高、就业层次提升，满足了新疆本地以及内地对信息化专门人才的需求。

计算机工程方向（本科）

主要课程：高等数学（工）、线性代数、概率论与数理统计（工）、离散数学（计）、计算机组成原理、、单片机原理与外围电路设计、C语言程序设计、数据结构、操作系统、计算机网络、数据库系统概论、软件工程、嵌入式系统开发技术、计算机网络、计算机图形学、编译原理等。

专业就业方向（领域）:培养在计算机数字硬件设计、嵌入式系统开发和应用、单片机应用与开发等领域有专长的信息化专门人才；就业方向为使用计算机和含有计算机设备的公司、科研单位以及各种企事业单位的计算机工程部门。

软件工程方向（本科）

主要课程:高等数学（工科）、线性代数、概率论与数理统计（工科）、离散数学（工科）、计算机组成原理、C++语言程序设计、数据结构、算法设计与分析、操作系统原理、计算机网络基础、数据库原理、软件工程、软件设计与体系结构、软件质量保证与测试、软件项目管理等，以及软件开发实训与实践课程。

专业就业方向（领域）:培养计算机科学与技术专业软件工程方向的专门人才，掌握包括软件需求、软件设计、软件构造、软件测试、软件维护、软件工程管理、软件工程工具和方法，以及软件质量管理等方面的知识。主要就业领域为软件开发企业、科研单位以及各种企事业单位的信息化管理部门等。此外，学生毕业后也可在校攻读“农业电气化与自动化”硕士学位。